Eppendorf生物反应器指以活细胞或酶为生物催化剂进行细胞增殖或生化反应提供适宜环境的设备。其结构、操作方式和操作条件的选定对生物化工产品的质量、收率(转化率)和能耗有密切关系，是生物反应过程中的关键设备。主要是指用于细胞培养、制药生产、动植物组织培养、微生物发酵生产、生物制品制备、污水处理等实验、生产提供反应环境的生产实验设备，有时也会被称为发酵罐或反应器。

　　该生物反应器具有在常温常压下操作要求能防染菌并且能蒸汽灭菌，制作材质对微生物或酶无毒害;酶常因底物浓度也不能太高，因而反应器体积相当庞大;反应前需接入菌种，为防止杂菌污染和活性衰退，一般采用分批釜式反应器;在发酵过程中，常是气、液、固三相并存，流变学性质复杂。

　　Eppendorf生物反应器提供了应用广泛的过程分析技术和过程控制策略的选择。以恒定速率控制混合可使培养物保持均匀。细胞、营养物和溶解气体分布均匀，较大程度地减少了组件的局部限制，并且可以准确、实时地测量整个过程参数。除了对培养物进行在线监测外，生物反应器甚至还可以在不干扰培养物的情况下对小体积样品进行离线分析。

　　在大规模细胞扩增的情况下，搅拌桨的剪切力、搅拌速率都会对细胞得生长产生影响。一般来说，搅拌速率需要足够高以保持微载体悬浮在培养物中并确保均匀混合以及充分的气体转移。同时，搅拌也应保持在低限速，因为过高的搅拌速率会因剪切应力而显着损害细胞生长。